En 1939, para la celebración de las bodas de plata del Gimnasio Moderno de Bogotá se llevaba a cabo un partido de fútbol entre el equipo del colegio y los ex-alumnos recién egresados de la misma institución, el equipo de los ex-alumnos vestía en ese entonces una camiseta blanca con una franja azul y era integrado por varios jóvenes que posteriormente promoverían la creación de Independiente Santa Fe.
No tenían en mente jugar como profesión o por dinero y enfrentaban otros equipos de la Capital, provenientes de escuelas y colegios. La mayoría de los jugadores del equipo estudiaban en el Colegio Mayor de Nuestra Señora del Rosario, por tal razón decidieron que el lugar de encuentro después de clases fuera el centro de la ciudad. No había entrenamientos rígidos como los de hoy, simplemente se encontraban en El Café del Rhin, en el Pasaje Santa Fe, doblaban hacia la séptima en la Avenida Jímenez donde se encontraban las instalaciones del Diario El Tiempo, pasaban por los tableros de El Espectador para doblar por la calle 14 y cerrar enfrente de la Universidad.
Trotar por el centro de Bogotá no era muy conveniente, puesto que se tropezaban con periodistas, conocidos políticos y gran cantidad de gente. Decidieron entonces trasladar sus “entrenamientos” a los Campos del Litográfico, para esa época ya eran “Los Santafereños”, nombre que había surgido por el punto de encuentro diario, El Pasaje Santa Fe.
Con el paso de las prácticas algunos jugadores empezaron a pensar en la formación de un equipo, Ernesto Gamboa Álvarez y Gonzalo Rueda quienes pasaban sus ratos libres en El Café del Rhin en el Pasaje Santa Fe eran los más animados con el tema, y se concretó la inscripción como equipo amateur a la Asociación Deportiva de Bogotá y se firmó el acta de constitución.
“En Bogotá, el 28 de Febrero de 1941, se reunieron los señores Escobar U. Guillermo, Gamboa A. Ernesto, Gutiérrez L. Tulio, Haim Roberto, Lleras Ll. Eduardo, Martín Alfonso, Martín Álvaro, Mendoza C. Eusebio, Mendoza C. Julián, Mora L. Hernán, Payán C. César, Reyes N. Luis Carlos, Robledo R. Luis, Rueda C. Gonzalo, Urdaneta H. Rafael y Valenzuela V. Pablo; y resolvieron crear un Club Deportivo de Foot-Ball Association que llevara por nombre “Club Independiente Santa Fe”. Dicho club tendrá un carácter meramente deportivo, sin perseguir lucro de ninguna especie. Su domicilio será en esta ciudad, y hasta la expedición de sus estatutos estará dirigido por la siguiente directiva: Presidente Gonzalo Rueda Caro, Vicepresidente Luis Robledo R., Secretario-Tesorero Ernesto Gamboa Álvarez, Capitan del equipo de Foot-Ball Luis Carlos Reyes Nieto.”
Centro de Bogotá - Pasaje Santa Fe
En 1941 Independiente Santa Fe fue Subcampeón de la Segunda Categoría de la Asociación Deportiva de Bogotá, sin embargo el club, tal y como lo dice su acta de fundación no tenía intenciones de lucro o profesionalismo, sin embargo para ese entonces Independiente Santa Fe era el equipo más popular entre los jóvenes de Bogotá, era tan fuerte la admiración que se sentía por el equipo que la prensa pedía a gritos el ingreso a la Primera División.
En Mayo de 1942 Santa Fe es invitado a Primera División de la Liga de Cundinamarca para enfrentar al poderoso equipo de la Universidad, partido en el que Independiente Santa Fe vistió por primera vez su camiseta roja con mangas blancas, ganó 7-3.
En los años siguientes el equipo empezó a figurar a nivel interdepartamental y empezó a distinguirse por su lucha, esfuerzo permanente y la mística de sus jugadores. En Marzo de 1943 Santa Fe jugó ante Bucaramanga en El Campín, en un partido que terminó 3-3 y fue reseñado por El Siglo así:
“A base de entusiasmo Santa Fe llevó el partido a un final que debe satisfacer a sus hombres profundamente, puesto que eran muchos los que no juzgaban a este equipo capaz de un desempeño tan lúcido frente a un cuadro de la categoría del de Santander. La performance de los muchachos de Santa Fe ayer, es digna de encomioy somos los primeros en aplaudirla”



